太湖流域管理局是水利部在太湖流域和浙江省、福建省闽江以北(含闽江)范围内的派出机构，国家授权其在上述范围内行使水行政管理职能。按照统一管理和分级管理的原则，统一管理本流域水资源和河道。负责流域的综合治理，开发管理具有控制性的重要水工程，搞好规划、管理、协调、监督、服务，促进江河治理和水资源综合开发、利用和保护。
　　一、主要职责
　　(一)负责《水法》、《水土保持法》等法律、法规的组织实施和监督检查，制订流域性的政策和法规；
　　(二)制订太湖流域水利发展战略规划和中长期计划。会同有关部门和有关省、直辖市人民政府编制流域综合规划和有关的专业规划，规划批准后负责监督实施；
　　(三)统一管理流域水资源，负责组织流域水资源的监测和调查评价。制订流域内跨省、直辖市水长期供求计划和水量分配方案，并负责监督管理，依照有关规定管理取水许可，对流域水资源保护实施监督管理；
　　(四)统一管理本流域河流、湖泊、河口、滩涂，根据国家授权，负责管理重要河段的河道；
　　(五)制订本流域防御洪水方案，负责审查跨省、直辖市河流的防御洪水方案，负责太湖流域直属工程和重要河流、湖泊的防洪调度工作。协调本流域防汛抗旱日常工作，指导流域内蓄滞洪区的安全和建设；
　　(六)协调处理部门间和省、直辖市间的水事纠纷；
　　(七)组织本流域水土流失重点治理区的预防、监督和综合治理，指导地方水土保持工作；
　　(八)审查流域内中央直属直供工程及与地方合资建设工程的项目建议书、可行性报告和初步设计。编制流域内中央水利投资的年度建议计划，批准后负责组织实施；
　　(九)负责流域综合治理和开发，组织建设并负责管理具有控制性的或跨省、直辖市重要水工程；
　　(十)指导流域内地方农村水利、城市水利，水利工程管理，水电及农村电气化工作；
　　(十一)承担部授权与交办的其它事宜。

　　二、机构设置
　　(一)机关机构
　　1．办公室(外事办公室)
　　2．水政水资源处(规划处)
　　3．计划基建处
　　4．财务处
　　5．人事劳动处
　　6．水利水电工程管理处
　　监察、审计、党群机构按有关规定设置。
　　(二)事业单位机构
　　1．水资源保护局(副局级)
　　2．综合经营管理中心(处级)
　　3．规划设计室(处级)
　　4．苏州管理处(处级)
　　5．太湖监测管理处(处级)
　　6．防汛调度中心(处级)
　　(三)企业单位
　　1．太湖水利水电开发公司
　　2．劳动服务公司

　　三、人员编制
　　太湖局事业编制为422人。
　　(一)局机关编制90人。
　　(二)局属事业单位编制332人。
　　太浦河、望虞河上的主要枢纽接收前，太湖局编制暂按180人控制。
　　(三)局领导职数为5人。
　　局机关职能部门正、副领导职数及局属二级机构副局级以上领导职数另行核定。
　　企业编制根据生产发展需要自行确定。