1、根据《劳动合同法》第9条规定，公司扣押你的毕业证书的行为是非法的。（第9条“用人单位招用劳动者，不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件，不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物”）；
2、如果毕业证还在你的手里，你可以给公司毕业证复印件，原件自己留着；
2、用人单位如违反本法规定，扣押劳动者毕业证的，由劳动行政部门责令限期退还劳动者本人，并依照有关法律规定给予处罚。因此，你可以到劳动监察大队投诉。