在我们国家,技术入股不属于公司法规定的出资范畴,因此,您的股份合作协议无效.

合同有效，技术入股受法律保护。建议《股东协议》的上述内容应当与在工商局备案的《公司章程》一致。详情可登陆本律师创办的的专业网站www.gudonglawyer.org.cn（中国股东维权网）了解公司设立基本法律常识。 

 协议有效，但是由于在工商机关没有备案，很容易引起纠纷，还是备案为好。

应依法变更章程登记

除了货币以外，作为股东出资的财产必须符合可估价性和可转让性两个条件，而以技术如股是指以技术成果入股，而以技术成果入股需要对该成果进行评估做价。你的股份合作协议是有效的，但是没有经过工商备案公示，你的股权在法律保障上有欠缺。

变更章程登记 

合同有效

股份合作协议有效

在法律上，只承认经过工商注册登记的股东权利。

实质你们是他出钱，你出技术组建一个公司，双方书面约定各自在公司所占资本股份比例，这种合作双方是自愿的不违反法律规定，应受到法律保护。但问题是既然你们是二人组建的公式为何公司登记时没有体现股份公司性质和你的股份身份。当时是基于何原因出现这种情况，是否存在他公司在前你入股在后情况，还是基于其他原因，可否简述以便商议。