只是三间房子（地上物）的使用权不包括院子

包括院子和土地使用权

    如果你叔叔是城镇居民，是不能对房屋占用的宅基地享有使用权的，所以事实上不包括院子。

不包括院子

根据房地一体原则，房子所有权转移等于宅基地转移，但你叔叔是居民，拆拆时你们还能主张宅基地补偿款。

这个要看具体情况。
一般不包括院子。

房地一体是一项原则，很不好办。

不包括院子。

不包括院子。