可以申请注销。

第一，你应该变更法人代表，只要公司存在，发生一切债权、债务，或因企业造成他人经济、财产、名誉上的损害，最后肯定会找到你这个法人代表。包括利用执照进行商业欺诈行为、买卖伪劣商品等。
第二，明年不年检，工商局将会吊销营业执照，只是工商局没有认可你继续合法经营，但是你的朋友继续营业属于无证经营，一般商业单位很少会到工商局查询工商执照是否有效，所以，有事还是会找到你。
第三，你不变更，假如你还想开其他公司是不可以的，因为你的名字在工商局已经注册了，所以一定要变更法人代表，对变更前的债权、债务有你承担解决，变更后的债权、债务有以后的法人代表承担。
第四，资料在他手上，最好问他要回来，实在不肯，你宁可花点钱，到工商局登记遗失申请，在当地日报上刊登遗失声明，凭报纸和缴费发票到工商局申请变更。以后他再以你的营业执照经营，是违法的。一切后果由他承担。