行政诉讼中，被告应当提出其行政行为合法的证据，而这种证据是在做出行政行为时就应当已有的，如果没有，事后是不能补证的，而第三人仅是参加诉讼人，其不能在诉讼中补充提交行政行为合法性的证据，即便被告自身也不能。所以第三人所提证据如果与此有关，是不能采信的。
  但不让证人作证，这不符合法律规定，法庭做法不妥当。
  诉讼中任何一方当事人均有权申请证人作证。
你所说情况，可能是第三人申请的证人要证明的内容是行政行为的合法性，法庭当然不会让其作证。因此，法庭采纳证人不能作证的意见。

具体可及时委托专业律师介入维权。。。。。