婚后两套房子应为你父亲和继母的共同财产，你父亲去世后，你继母和你们所有的孩子每人一份继承。但由于多年没有继承，应视为放弃。你可以不分给他们。

你好！威海苏律师解答如下：1、法定继承适用最长时效二十年；2、继承放弃应明示，该事件不存在放弃继承情形；3、两栋房产系父亲与继母的共同财产，其中50%份额系继母所有，父亲去世时未留有遗嘱，则其所有50%份额发生法定继承，继承人为继母、你与你妹妹（继母的儿女没有继承权）；4、要看到你与继母的协议才能确定协议的效力，最终协议被认定有效或无效对本案都会产生影响；5、12年后通过诉讼办的另一处房产的房权，诉讼结果所认定的事实可能会作为证据有助于事实的认定。

既然有协议就按协议约定的处理。建议委托律师帮助处理。