房屋产权以登记为准，登记在谁名下产权归谁所有。既然房屋合同是你们夫妻二人的名字，那么按照购房惯例，房屋产权也会登记在双方名下，没有约定比例的情况下，双方共同共有，各自占有一半份额。那么根据你描述的情况，对你提出的问题分别解答如下： 我的补充： 2012-10-06 19:51

1，我们协议离婚，不知道房产证下来后如何去掉女方名字？
协议只要是双方自愿签订的，没有违法内容就是合法有效的。既然你们双方协议离婚，有协议的应当按照协议处理，房屋产权归属可以在合同中明确约定。
如果协议约定该房屋归男方所有，那么你可以要求去掉女方的名字。但这里有个问题是你必须要注意的，因为对于贷款购买的房屋来说，要去掉共有人姓名是需要首先将贷款还清的，贷款未还清之前，无法办理变更共有人登记，第一是房管局不受理，第二是银行不同意。
也许有说法是只要你经过银行同意就可以办理，但这绝对是个理论说辞，因为银行不可能同意，明明是两个产权人，还贷风险较小的情况下，银行绝不会去掉一个还贷或者还贷保证人，将这种风险加大由银行承担的，至少实践中，银行还没有同意过的先例。
另外，房屋贷款购买的，很多房屋是暂时没有房产证的，产证都抵押在银行。即便你取得了产证，也必须首先将贷款还清，然后到房管局办理变更共有人登记。

2，怎么办理？需要交什么费用？
如果你的房屋贷款还清，那么需要首先到银行解押，将抵押手续办理完毕。而后带上房产证、身份证、双方离婚证、离婚协议及房屋抵押手续解除完毕等文件到房管局，提交变更共有人登记申请，房管局审核通过后即可。
费用方面都是根据你房屋具体情况收取的，原则上夫妻之间做更名登记不收取税款，只需要交纳少量的工本费即可，具体到时候以房管局给你计算的数额为准。

3，女方再买房算二套吗？
所谓二套房是指名下已经有一套房屋的情况下，再次购买房屋且登记在本人名下，这才能算作是二套房。
如果你们房屋仍然登记在双方名下，女方再次购买房屋的，那么肯定是二套房，不过女方是北京户口，是允许购买二套房的，从限购政策来说，并没有什么实质影响。
如果你们的房屋还清贷款后，成功去掉了女方名字，或者通过一些非正常途径将女方的姓名去掉了，那么女方名下就没有房屋了，这样女方再次购买房屋就不能算二套了，只能算首套。
总是二套是根据名下实际上有几套房产确定的，和曾经购买过、出售过多少套房产都没有关系。

4，关于离婚的其他相关问题。
（1）,关于是否能够离婚：
离婚是个人的权利与自由，如果双方都同意离婚,那么可以协议离婚，双方签订离婚协议，到民政机关办理离婚登记即可；如果有一方不同意离婚，那么另一方也可以诉讼离婚。在诉讼离婚的情况下，只要法官认定夫妻双方感情确已破裂，不适合继续共同生活的，就会判决离婚。
认定夫妻双方感情确已破裂的因素有很多，比如双方分居满两年、家庭暴力、重婚或有恶习屡教不改等。
(2),关于财产分割：
婚前取得的财产归个人所有，婚后取得的财产，没有特殊情况的应当认定为夫妻共同财产，在离婚时原则上双方平均分割。如果对方有过错，你可以适当多分财产以作补偿。但一般不存在赔偿的问题，就离婚要求精神损失费或青春损失费的，法院不会支持。
(3),关于债务承担：
婚姻关系存续期间，产生的债务如果用于家庭生活，那么属于共同债务，由双方共同承担；否则属于一方的个人债务由，个人承担。
(4),关于孩子抚养权：
孩子的抚养权双方协商,一般本着利于孩子成长的原则处理,如果孩子较小,随母亲可能性大.如果是两个子女,一般父母各抚养一个.不抚养孩子一方有探视权，同时需要支付抚养费,一般以实际收入的20%-30%为限.可以要求一次性支付. 负担两个子女抚养费的，比例可适当提高，但一般不得超过月收入的50%。无固定收入的，抚养费的数额可依据当年总收入或同行业平均收入，参照以上比例确定。
抚养费可以根据孩子的实际生活需要或者支付抚养费的实际经济情况相应变更，可以要求增加也可以要求减少。
不能以不要抚养费为由剥夺对方的探视权，是违法的。
(5)，关于管辖法院和所需材料：
起诉离婚需要到被告所在地法院起诉，被告户籍地和经常居住地法院都可以。
起诉离婚需要准备诉状、双方身份证件、结婚证以及要求分割财产的证明等相关证据即可。
建议协商解决,协商不成可以起诉,也可以委托律师代为诉讼。

5,总结意见。
房屋登记在你们双方名下，产权应当归你夫妻共同所有。但贷款购买的房屋，在贷款还清之前都无法办理共有人变更登记，即便是你一个人还贷也办不了，首先银行不会同意，其次房管局也不会受理，只能等贷款还清后才能去掉女方姓名。
女方在本房屋去掉姓名后，再次购买的房屋应当认定为首套，而不是二套房。
具体变更流程，还需要根据你房屋详细情况来确定，另行咨询银行和房管局也是非常必要的。