结婚后才发现患有医学上不认为不能结婚的疾病，在法律上如何处理？

你好：
    你这种婚姻属于无效婚姻，也叫违法婚姻，虽然你们办理了结婚证但是你们的这种结合因违反了法律规定的结婚要件而不具有法律效力的一种婚姻形式。
    我国《中华人民共和国婚姻法》第十条规定，有下列情形之一的婚姻无效：
    1.重婚的；
    2.有禁止结婚的亲属关系的；　　
    3.婚前患有医学上认为不应当结婚的疾病，婚后尚未治愈的；
    4.不到法定婚龄。
    对于无效婚姻相关当事人可以申请法院宣告婚姻无效。 因此你可以向法院申请宣告婚姻无效。