针对司法鉴定人科学、客观、独立、公正的执业特点，《司法鉴定人登记管理办法》将权利和义务单设一章，规定了司法鉴定人的九项权利和九项义务，即司法鉴定人除应具有公民的权利与义务外，还应具有执业活动中参与诉讼的权利和义务，如拒绝不合法鉴定委托的权利，询问被鉴定人的权利，保留不同鉴定意见的权利，按时出具鉴定结论的义务，回避的义务，出庭作证的义务等。
法律责任的设定直接关系到司法行政部门行政处罚是否合理、合法的问题，两规章严格按照《决定》规定设定处罚范围和方式，对处罚种类进行了细化和列举。为明确鉴定人和鉴定机构的民事责任，强化鉴定人和鉴定机构的责任意识和风险意识，保障司法鉴定质量，两规章规定：鉴定人和鉴定机构因违法执业给当事人造成损失的，应当按照民事法律的有关规定予以赔偿。
