在发生仓储合同争议后，合同的双方当事人应当先进行友好协商，争取达成双方比较满意的协议。

如果合同双方达不成协议，则可以由当地工商行政管理部门进行调解。

如果双方协商或经过工商行政部门调解不成的，可以选择仲裁或者向人民法院提起诉讼。