房屋租赁合同依法进行备案登记会涉及缴纳税费问题。合同双方应对缴纳税费进行约定，可以约定全部由一方缴纳 ，也可以按国家税法规定方式缴纳，避免产生纳税争议。一般来说出租房屋应纳房产税、城镇土地使用税、营业税 、城市建设维护税、教育费附加和印花税。房产税、城镇土地使用税、营业税、城市建设维护税、教育费附加按综合征收率征收 ：对在房产税开征范围内出租房屋的，各地方制定的标准不一样；印花税：按租赁金额的千分之一贴花。